Une série de naufrages inexpliqués défraie la chronique japonaise. Au même moment, à la suite de plusieurs pêches infructueuses, les insulaires de l'île Odo organisent une cérémonie pour apaiser la colère de "Gojira", un dragon marin vénéré depuis des temps immémoriaux. Mais la nuit venue, quelque chose débarque sur l'île dans une tempête et piétine le village. Le lendemain, le professeur Kyohei Yamane examine le sol et découvre des traces de radioactivité ainsi qu'un trilobite. Un gigantesque monstre reptilien apparaît bientôt aux yeux de tous, avant de s'enfoncer dans la mer.
Bingo-Maru Sinking — Akira Ifukube
Eiko-Maru Sinking — Akira Ifukube
Main Title — Akira Ifukube
Ritual Music of Odo Island — Akira Ifukube
Odo Island Theme — Akira Ifukube
Horror in the Water Tank — Akira Ifukube
Shinagawa Pandemonium — Akira Ifukube
Godzilla Comes Ashore — Akira Ifukube
Fury of Godzilla — Akira Ifukube
Deadly Broadcast — Akira Ifukube
Repel Godzilla — Akira Ifukube
Godzilla to Tokyo Bay — Akira Ifukube
Devastated Tokyo — Akira Ifukube
Oxygen Destroyer — Akira Ifukube
Frigate March Ⅱ — Akira Ifukube
Godzilla Under the Sea — Akira Ifukube
Storm on Odo Island — Akira Ifukube
Godzilla Appears on Odo Island — Akira Ifukube
Uneasiness on Odo Island — Akira Ifukube
Attack Godzilla — Akira Ifukube
Prayer for Peace — Akira Ifukube