Le ministère de la Défense fait part de sa volonté de supprimer les subventions du centre de recherche, ce qui risque de causer la fermeture d'Eureka. Zoe vient rendre visite à son père peu de temps avant sa remise de diplôme. Mais celui-ci doit entrer dans une faille spatio-temporelle pour sauver les habitants de l'attaque de trous noirs incontrôlés...