Une jeune femme, lieutenant de la Marine, est retrouvée sans vie dans la chambre d'un motel d'une petite ville. Une fois sur place, Gibbs et son équipe apprennent que la scène de crime a été nettoyée et que l'autopsie du corps a déjà été pratiquée par le médecin local. Selon le shérif de la ville, un problème de communication serait à l'origine de cela. Malgré tout, Gibbs reprend l'enquête comme il peut. Au fil des jours, le NCIS émet l'hypothèse que le meurtre soit lié à l'action d'une cellule terroriste...