Ramiel fait son apparition dans le ciel de Tokyo-3. Son objectif semble être le QG de la NERV, dont il se rapproche rapidement. Shinji et Rei sont envoyés pour l'intercepter. A peine sorti avec son Eva, Shinji est repéré par l'Ange qui s'attaque immédiatement à l'Unité-01. L'attaque est extrêmement violente et Shinji gravement blessé. Tandis qu'il est ramené aux urgences, Rei se retrouve seule face à l'Ange, qui ne tarde pas à déployer son attaque contre la NERV. Se plaçant à la verticale du QG, l'Ange commence à transpercer la paroi extérieure du bâtiment souterrain de la NERV. Les heures de l'humanité semblent comptées. Mais Misato met au point un plan audacieux: se servir d'un canon à positron pour éliminer l'Ange. Le canon disposera de la puissance électrique du Japon tout entier.
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