Tom se réveille un matin et se rend compte que tout autour de lui a changé : Kyle a été reçu à une école de médecine et n'a jamais sombré dans le coma, il apprend par Diana qu'il a été torturé lors d'une mission d'infiltration pour le NTAC, il est marié depuis 2 ans à Alana, Jordan Collier est toujours vivant et les 4400 n'ont jamais existé. Tentant désespérément de savoir ce qu'il se passe, il découvre une étrange porte qu'il est seul à voir dans l'ancien Centre des 4400 devenu le musée Collier...